Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PHC1P78364 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms