Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms