Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP1P30622 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms