Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LMO1P25800 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LMO1P25800 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms