Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PDE6GP18545 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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