Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHGAP10645 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms