Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPLO60437 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPLO60437 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPLO60437 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPLO60437 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms