Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRTO14522 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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