Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SRRM4A7MD48 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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