Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK3Q9UBP4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms