Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms