Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NRIP3Q9NQ35 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms