Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms