Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms