Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPR78Q96P69 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms