Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms