Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLNKQ7Z7G1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms