Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBAP2Q5T6F2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBAP2Q5T6F2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms