Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDO1Q16878 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDO1Q16878 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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