Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SLC10A1Q14973 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms