Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERV3-1Q14264 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms