Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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