Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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