Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMF1P82094 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMF1P82094 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMF1P82094 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMF1P82094 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMF1P82094 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms