Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BACE1P56817 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BACE1P56817 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BACE1P56817 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms