Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA3P34903 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms