Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2A2P16615 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms