Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 IL6-201ENST00000258743 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXB1P14653 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms