Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POP4O95707 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POP4O95707 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POP4O95707 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms