Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC87Q9NVE4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms