Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOMER3Q9NSC5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOMER3Q9NSC5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms