Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD2AQ9BW72 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms