Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NIPSNAP1Q9BPW8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NIPSNAP1Q9BPW8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NIPSNAP1Q9BPW8 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NIPSNAP1Q9BPW8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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