Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms