Protein–RNA interactions for Protein: Q8N386

LRRC25, Leucine-rich repeat-containing protein 25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25Q8N386 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRC25Q8N386 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms