Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP34Q70CQ2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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