Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms