Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HSD17B12Q53GQ0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms