Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ALX1Q15699 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ALX1Q15699 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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