Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCAPHQ15003 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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