Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB40BQ12829 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms