Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CENPEQ02224 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CENPEQ02224 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms