Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACADSBP45954 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACADSBP45954 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms