Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL9P32969 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL9P32969 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms