Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPREP23469 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPREP23469 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPREP23469 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPREP23469 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPREP23469 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPREP23469 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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