Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLR1AO95602 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLR1AO95602 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms