Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POLR3CQ9BUI4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms