Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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