Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms