Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG3Q96JB2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms